La diarrea es aguda cuando presenta un comienzo brusco y una duración menor de 2–3 semanas. Más del 90% de los casos corresponden a etiologías infecciosas, siendo en la mayoría de los casos procesos autolimitados. Uno de los principales dilemas consiste en decidir cuándo solicitar pruebas diagnósticas. Dada su baja rentabilidad, se indican sólo en determinadas situaciones: analítica básica de sangre en pacientes con criterios de gravedad o en el contexto de brote epidémico; coprocultivos ante la sospecha de infección por Salmonella spp., Campylobacter spp., Shigella spp., Yersinia spp., Aeromonas spp. o Vibrio spp.; la toxina de Clostridium difficile en heces ante la sospecha de colitis pseudomembranosa; las técnicas endoscópicas ante la sospecha de enfermedades no infecciosas y muy ocasionalmente infecciosas (Giardia lamblia, citomegalovirus, colitis pseudomembranosa, etc.).

Diarrhea is acute when it presents an abrupt onset and it duration is less than 2-3 weeks. Over 90% of cases have an infectious etiology and run an self-limited process. One difficult decision is determining when to carry out diagnostic tests. These test are only indicated in some situations: blood test in patients with severity criteria or in the context of outbreak; stool cultures when infections caused by Salmonella spp., Campylobacter spp., Shigella spp., Yersinia spp., Aeromonas spp. or Vibrio spp. are suspected; Clostridium difficile toxin in pseudomembranous colitis; endoscopic techniques for suspected non-infectious diseases and occasionally infections (Giardia lamblia, cytomegalovirus, pseudomembranous colitis, etc.).