Los gérmenes anaerobios producen frecuentemente infecciones abscesificadas y polimicrobianas que pueden afectar a diferentes localizaciones del organismo. La mucosa de la cavidad oral es uno de sus principales reservorios, por lo que son gérmenes habituales tanto en las infecciones bucodentales como en las que se producen tras mordeduras de animales. Además colonizan el tubo digestivo, siendo también responsables de una de las infecciones nosocomiales que más relevancia ha adquirido en los últimos años, la infección asociada a Clostridium difficile, principal agente causal de la diarrea asociada a tratamiento antimicrobiano.

Anaerobes have been isolated in infections of virtually all anatomic sites, usually causing polymicrobial infections. Cavity oral mucosal surface is normally colonized by anaerobes, and anaerobic bacteria are involved in odontogenic and animal bite wound infections. Morever, Clostridium difficile colonizes the human intestinal tract and it is the main cause of antibiotic-associated colitis. C. difficile infection is one of the most common healthcare-associated infections and a significant cause of morbidity and mortality among hospitalized patients.