Las infecciones respiratorias agudas (IRA) constituyen la patología infecciosa más frecuente, generalmente son el principal motivo de consulta en atención primaria. El diagnóstico etiológico que realiza el laboratorio de microbiología clínica es, en muchos casos, orientador por su dificultad en la interpretación del valor de los microorganismos aislados en relación con su significación clínica, por lo que estará acompañado de la evaluación de datos que ofrecen la historia clínica y la exploración; es importante la calidad de la toma de muestra, el procesamiento y la interpretación para el diagnóstico etiológico correcto y el tratamiento adecuado del paciente. El objetivo es realizar una actualización de las indicaciones e interpretación de las principales muestras respiratorias obtenidas para el diagnóstico bacteriológico/molecular, según características especiales de aquellos microorganismos de principal sospecha.

Acute respiratory infections (ARI) are the most frequent infectious disease. Worldwide, they are the main reason for consultation in primary care. In many cases, the etiological diagnosis made by the clinical microbiology laboratory is orientative because of the difficulty in interpreting the value of the isolated microorganisms in relation to their clinical significance. Therefore, it is be accompanied by an assessment of the data provided by the medical record and examination. The quality of sampling, processing, and interpretation are important for a correct etiological diagnosis and adequate treatment of the patient. This work aims to update the indications and interpretation of the main respiratory samples obtained for bacteriological/molecular diagnosis according to the special characteristics of the most commonly suspected microorganisms.